تربیت طلاب متخلق، عالم و ماهر در کاربست دانش، مهم­ترین رسالت نظام علمی- تربیتی حوزه ­های علمیه بوده، تدوین برنامه ه­ای منسجم، مهارت ­بخش و عملگرا به منظور تربیت طلاب کارآمد، جزو مطالبات جدی مدارس علمیه به شمار می­ رود. لذا غنابخشی پژوهشی برنامه درسی از طریق اشراب پژوهش در مولفه های برنامه درسی، موثر دانستن میزان توان­مندی پژوهشی طلاب در ارتقا و فارغ التحصیلی آنها، در اولویت قراردادن برنامه­ های پژوهشی از جهت حمایت­های مادی و….می­ تواند در دستیابی به وضعیت مطلوب بسیار تاثیر بگذارد. قراردادن پژوهش در متن برنامه آموزشی، مطمئن ­ترین راه برای وصول به هدف است. 

هدف کلان پژوهشی سطح دو عبارت است از: تربیت متتبع.

اهداف خرد عبارت‌اند از:

1-     شناخت پژوهش در حد تتبع

2-    ایجاد و تقویت انگیزه، روحیه و علاقمندی به پژوهش

3-     مهارت پژوهشگری در حد تتبع

4-    تقویت اخلاق پژوهشی

بعضی از ساعات پژوهشی از طریق فایل ها صوتی و تصویری برگزاری می شود که از طرف مرکز مدیریت حوزه های علمیه خواهران در قم تهیه  می گردد و بعضی دیگر توسط اساتید توانمند و مجرب برای طلاب ارائه می گردد.